咖啡树是一种常绿乔木，开白色的小花，结绿色的果实，一直到成熟时才转为红色。正常的一株咖啡树通常可以长到5到10公尺高，不过为了采收方便，豆农们常将其修剪至2公尺以下。开花后结出一颗颗深绿色椭圆的果实，成熟的果实由深绿转成鲜红色，由于色泽与樱桃相近，故昵称之「樱桃」，而每颗「樱桃」里又含有一对种子，这对种子就是所谓的咖啡豆。
咖啡花，白色，花冠5裂片，反卷，散发浓烈香气。树龄 4~5 年的咖啡树都会开花，花期约在2~3 月，咖啡花在外观和气味与茉莉花相似，开花时紧生于咖啡树枝呈簇状。白色的花瓣及清淡的茉莉花香，显得高贵优雅，但可惜它的花期极短约 3~5 天。因此能够欣赏咖啡园内咖啡花海的盛况是非常难得的机会。咖啡花开后，便慢慢结成绿色咖啡果实。
未成熟咖啡果实为绿色，经过 6~7 个月的成熟期后，成熟的果实外皮呈红色，由于其形状与颜色与樱桃相似，因此，外国人称成熟咖啡果实为樱桃 (Cherry) ，在鲜红的外果皮下，是果皮一种甜甜的黏黄物质包住整个咖啡豆。正常情况下每颗果实有两粒咖啡豆，扁平面相对，咖啡豆的表面有一层非常薄的隔膜组织─银皮 (Silver Skin)，每粒咖啡豆与其银皮皆位于有防护作用的坚硬乳色豆形壳裹，叫内果皮(Parchment)，作用是把咖啡豆和黏液分开。
正常的咖啡树有时会长出一些较小的果实，里面只有一粒咖啡豆，这种单粒咖啡豆有不同的名称，叫圆豆(Peaberry)、或单豆，它不会有扁平的一面，相反的，它的体型较小，且几乎成圆形。由于其量非常的少，且必须特别的挑选、搜集在一起，因此，它的价格比平常的咖啡豆高出很多，很多人觉得圆豆的味道特别好，是因其圆形的豆形能将咖啡的原味，紧包密于豆中，味道特为浓烈。许多咖啡喜爱者，视它为咖啡豆中的极品。
